《分子植物育种》是由国家科技部批准，国家新闻出版署核准的学报级刊物，本刊为大16开本，全年出刊24期。铜版纸彩色印刷，国内外公开发行的生命科学学术期刊（半月刊）。本刊“立足国内，面向国际”，是一份为转基因育种、分子标记辅助育种及常规育种服务的国际性科学杂志。本刊围绕水稻、小麦、玉米、油菜、大豆、棉麻、薯类、果树、蔬菜、花卉、茶叶、林草等，主要刊登分子遗传育种理论、分子育种方法、分子育种研究动态以及优良种质培育等方面的科学论文报道。

1）北京大学图书馆《中文核心期刊要目总览》(2011~2023年版)之核心期刊

2）中国科学技术信息研究所的中国科技论文统计源期刊之核心期刊(2010年开始入选)

3）中国科学院文献情报中心的中国科学引文数据库(CSCD)入选期刊(2015~2016年, 2017~2018年, 2019~2020年)

4）RCCSE中国核心学术期刊（A）

5）中国农林核心期刊（A）

6）中国知网的中国期刊全文数据库(CJFD)

本刊被美国化学文摘(CA)、日本科学技术振兴机构数据库(日)等境外数据库收录。