1、 期刊论文
a.引用的参考文献作者人数为1人时
作者姓名，年份，文献题名，刊名，卷号(期号) ：起止页码。
在正文中直接列出作者的姓氏，加论文发表的年份。
例如：
Jiang S.Y., 2003, Rice mutant population and its applications on functional genomics, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 1(2): 137-150 (江树业, 2003, 水稻突变群体的构建及功能基因组学, 分子植物育种, 1(2): 137-150)
在正文中引用格式为：(江树业, 2003)
b.引用的参考文献作者人数为2人时
作者姓名，年份，文献题名，刊名，卷号(期号) ：起止页码。在正文中列出2位作者的姓氏，加论文发表的年份。
例如：
Fang X.J., and Wu W.R., 2003, Molecular selection, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 1(1): 1-5 (方宣钧, 吴为人, 2003, 分子选择, 分子植物育种, 1(1): 1-5)
在正文中引用格式为：(方宣钧和吴为人, 2003)
Fukui K., and Iijima K., 1991, Somatic chromosome map of rice byimaging methods, Theor. Appl. Genet., 81: 589-596
在正文中引用格式为：(Fukui and Iijima, 1991)
c.引用的参考文献作者3人或3人以上时
作者姓名，年份，文献题名，刊名，卷号(期号) ：起止页码。
在正文中直接列出第一作者的姓名(英文用第一作者的姓)及论文发表的年份，后加“等”或“et al.”。
例如：
Duan Y.S., Zhao S.H., Wu W.R., Zhou Y.C., Qi J.M., Pan R.S., Lin L.H., Chen Z.W., Gong H.Z., and Mao D.M., 2003, Saturating a molecular linkage map of rice with SSR markers, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 1(4): 475-479 (段远霖, 赵守环, 吴为人, 周元昌, 祁建民, 潘润森, 林荔辉, 陈志伟, 宫华忠, 毛大梅, 2003, 用SSR标记提高水稻分子连锁图谱密度, 分子植物育种, 1(4): 475-479)
在正文中引用格式为：(段远霖等, 2003)
Causse M.A., Fulton T.M., Cho Y.G., Ahn S.N., Chunwongse J., Wu K., Xiao J., Yu Z., Ronald P.C., Harrington S.E., Second G., McCouch S.R., and Tanksley S.D., 1994, Saturated molecular map of the rice genome based on an interspecific backcross population, Genetics, 138: 1251-1274
在正文中引用格式为：(Causse et al., 1994)
d.私人通讯和Internet 网站上的信息和资料的引用
直接在正文中引用，文后参考文献中不必列出
例如：
私人通讯引用形式：(吴为人, 2003, 私人通讯)
Internet网站上的信息和资料的引用方式：(林刚和何玫, 2002, www.wenweipo_com.htm)或(http://info.Jstage.jst.go.jp/contents/info/list/eng.html)
2、专著
作者姓名，著/编著/ed., (如为译著还应写出译者姓名) 出版年份，书名，版次(初次不写)，出版者(出版社)，出版地(国家和城市)，pp.+ 引文页码。
在正文中的引用方法同期刊论文
例如：
Fang X.J., Wu W.R., and Tang J.L., eds., 2002, Moleclar marker assistant breeding in crop, Science Press, Beijing, China, pp.1-84 (方宣钧, 吴为人, 唐纪良, 编著, 2002, 作物DNA标记辅助育种, 科学出版社, 中国, 北京, pp.1-84)
Altman A., and Waisel Y., eds., 1997, Biology of root formation and development, Plenum Press, New York and London, pp.376
Buchanan B.B., Gruissem W., and Jones R.L., eds., Qu L.J., Gu H.Y., Bai S.N., Zhao J.G., and Chen Z.L., trans., 2004, Biochemistry & molecular biology of plants, Science Press, Beijing, China, pp.250-288 (布坎南 B.B., 格鲁依森姆 W., 琼斯 R.L., 主编, 瞿礼嘉,顾红雅, 白书农, 赵进东, 陈章良, 主译, 2004, 植物生物化学与分子生物学, 科学出版社, 中国, 北京, pp.250-288)
3、论文集或专著中析出文献
作者姓名，出版年份，文献题名，见(In)：论文集编者+ (编著或ed.)，论文集名，出版者，出版地，pp.+ 引文页码。
在正文中的引用方法同期刊论文
例如：
Shoemaker R.C., Polzin K.M., Lorenzen L.L., and Specht J.E., 1996, Molecular genetic mapping of soybean, In: Verma D.P.S., and Shoe maker R.C. (eds.), Soybean: genetics, molecular biology and biotechnology, CIAB International, Wallingford, UK, pp.37-56
Zhang Q.F., 2007, Toward the development of green super rice using genomics-based strategies, In: Li Z.K., Fang X.J.(eds.), Proceedings of the 2nd international conference of plant molecular breeding, 23~27, March, Sanya, Hainan, China, pp.3
4 、学位论文
作者姓名，年份，论文题名，申请学位类型，培养单位，指导教师姓名，pp.+ 引文页码(如必要)。
在正文中的引用方法同期刊论文
例如：
Jiang L.R., 2004, Improvement of appearance traits of elite rice Zhenshan 97B by molecular introgression of targeted about 800 kb interval from indica rice Jia-fuzhan genome, Thesis for M.S., Life Science and Technology Institute, Guangxi University, Supervisor: Fang X.J., pp.453-454 (江良荣, 2004,分子标记辅助渗入佳辐占基因组约800 kb区间定向改良珍汕97B外观品质, 硕士学位论文, 广西大学生命科学与技术学院, 导师: 方宣钧, pp.453-454)
Wan Y.S., 2002, Construction of soybean genetic map and QTL analysis of some agronomic traits, Dissertation for Ph.D., Biotechnology Research Institute CAAS, Supervisor: Jia S.R., and Fang X.J., pp.37-39 (宛煜嵩, 2002, 大豆遗传图谱的构建及若干农艺性状的QTL定位分析, 博士学位论文, 中国农业科学院研究生院, 导师: 贾士荣, 方宣钧, pp.37-39)
5、专利文献
专利所有者姓名，授予专利或公开年份，专利题名，专利国别，专利号/申请号，并在参考文献中的引用。
例如：
Liu Q.L., Bai S.Y., and Ma Y., 2004, An plant expression vector pBinETR1 of ethylene unsusceptivity and application, China Patent, ZL02126837.1 (刘青林, 白双义, 马祎, 2004, 一种乙烯不敏感的植物表达载体pBinETR1及其应用, 中国专利, ZL02126837.1)
Holton T.A., 1996, Transgenic plants exhibiting altered flower color and methods for producing same, United States Patent, US006080920A
6、其它
无论是期刊、专著、论文集、学位论文或专利文献，当作为参考文献没有正确的英文(出版时没有英文题目等)对照时，直接在正文中以作者、年、刊名、期卷号、页码的形式列出，在文后参考文献中不用再列。
例如：(陈志贤等, 1987, 中国农业科学, 20(5): 6-11)