研究报告 / Research Report

基于基因组鉴定小桐子Dof转录因子家族及其表达分析  

王海波1,2 , 唐利洲1,2
1曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心, 曲靖, 655011;
2曲靖师范学院云南省高校云贵高原动植物遗传多样性及生态适应性重点实验室, 曲靖, 655011
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2017年04月22日    接受日期: 2017年07月11日    发表日期: 2018年03月12日
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摘 要

Dof蛋白是植物特有的C2-C2型锌指蛋白类转录因子,在植物碳氮代谢、次生物质合成、种子萌发及抗逆性等方面发挥重要作用。为全面解析小桐子Dof基因的特征,本研究利用生物信息学方法对小桐子Dof基因在全基因组范围进行了鉴定,并对其基因结构、系统进化、保守结构域及差异表达特性进行了分析。结果表明,在小桐子基因组中共鉴定到24个Dof基因,GSDS基因结构分析显示都包含1(9个)或2(15个)个外显子,聚类分析结果将24个小桐子Dof蛋白分属于4个亚家族及7个亚组,其中,有16个(66.7%)Dof蛋白的等电点偏碱性。荧光定量表达分析显示,JcDof1.4LJcDof5.4L分别在茎与根中高表达,且两者都属于低温诱导表达基因,分别在低温胁迫3h与24h达到最大表达量,较对照分别提高4.06倍、8.96倍(p<0.01)。本研究结果为深入开展小桐子Dof基因的功能鉴定及其在小桐子遗传改良中的应用提供了依据。

关键词
小桐子;Dof;基因家族;转录因子;锌指蛋白;抗逆性;表达分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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