研究报告

杜鹃花 SCoT-PCR 反应体系的优化及引物筛选  

郑福超1 , 耿兴敏1* , 谷康1 , 闫娜2 , 罗凤霞 2 , 肖丽燕1
1 南京林业大学风景园林学院, 南京, 210037; 2 金陵科技学院园艺学院, 南京, 210038
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 19 篇   
收稿日期: 2017年04月20日    接受日期: 2017年06月09日    发表日期: 2018年06月22日
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摘 要

本试验以马银花(R. ovatum) DNA 为模板,采用 L16 (45)正交试验对目标起始密码子多态性 - 聚合酶链式反应(SCoT-PCR)体系中 5 因素(Taq 聚合酶用量, Mg2+ 浓度, 模板 DNA 用量, dNTPs 浓度, 引物浓度)进行了优化,建立了杜鹃花植物 SCoT-PCR 反应体系。结果表明,在 20 L 的反应体系中,模板DNA 1.00 ng/滋LMg2+ 3.00 mmol/LdNTPs 0.25 mmol/L,引物为 0.50 mol/LTaq DNA 聚合酶为 2.00 U。比较了各因素对反应体系的影响,发现引物物浓度的差异对体系影响显著,各因素影响的先后顺序为引物>Taq DNA 聚合酶>dNTPs>Mg2+>模板 DNA。并运用了杜鹃属的 4 个不同种对最优体系进行了稳定性验证,选择了 10个通用性的引物进行筛选,发现 10 个引物均能扩增出条带,其中有 6 个引物能够得到清晰可辨、多态性丰富的条带。该体系的建立将为杜鹃花遗传多样性、差异基因的表达分析,分子辅助育种、遗传图谱构建等研究提供技术支持。

关键词
杜鹃花;SCoT;PCR;单因子;正交试验
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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