1 山东省农业科学院作物研究所, 济南, 250100
2 山西省农业科学院谷子研究所, 长治, 046011
*同等贡献作者
作者
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《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 5 篇 doi: 10.3969/mpb.011.000030
收稿日期: 2012年08月17日 接受日期: 2012年09月12日 发表日期: 2012年10月08日
2 山西省农业科学院谷子研究所, 长治, 046011
*同等贡献作者
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《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 5 篇 doi: 10.3969/mpb.011.000030
收稿日期: 2012年08月17日 接受日期: 2012年09月12日 发表日期: 2012年10月08日
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摘 要
对从Phytozome数据库中获取的谷子基因组序列进行搜索,在21 150.78 kb序列中发现2 872个SSR,平均每7.36 kb就有一个SSR;共发现126种重复基元,其中二核苷酸和三核苷酸类型分别占63.41%和31.86%。初步设计了74对SSR引物,其中64对引物可以稳定扩增。利用40对引物对27份谷子品种进行多态性检验,27对引物扩增良好且多态性丰富,共扩增出220个等位变异,平均每个位点8.15个。
关键词
谷子;基因组序列;SSR;多态性