番茄WRKY转录因子in silico鉴定及表达分析  

万红建 , 俞锞 , 袁伟 , 刘云飞 , 叶青静 , 王荣青 , 阮美颖 , 姚祝平 , 杨悦俭
浙江农业科学院蔬菜研究所, 杭州, 310021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 13 篇   doi: 10.3969/mpb.011.000090
收稿日期: 2012年08月14日    接受日期: 2012年09月13日    发表日期: 2012年10月09日
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摘 要

WRKY蛋白是植物中最大的转录因子家族之一,对植物的生长发育具有重要调控作用。本研究利用番茄全基因组测序结果鉴定了WRKY基因,分析了其系统发育关系,内含子-外显子结构,染色体上的分布及其表达方式。研究表明:番茄中存在81个WRKY转录因子,分为三类(Ⅰ, Ⅱ和Ⅲ),第Ⅰ和Ⅱ类分别细分为2和5个亚类,这些基因不均匀分布在番茄的11条染色体上;基因结构分析表明番茄WRKY转录因子进化过程中可能发生内含子的缺失/获得事件;不同芯片表达分析表明WRKY基因不仅参与了番茄根、子叶和真叶等不同组织类型的生长发育,而且还参与了一些生物胁迫(盐)和非生物胁迫(真菌激活子)的反应。

关键词
番茄;WRKY转录因子;生物信息学;表达分析
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《分子植物育种》印刷版
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