研究报告

大豆SNP分型方法的比较  

, 赵勇 , 刘晓冬 , 赵洪锟 , 袁翠平 , 齐广勋 , 王玉民 , 董英山
1吉林农业大学农学院, 长春, 130118; 2吉林省农业科学院大豆研究所, 长春, 130124; 3吉林省农业科学院作物资源研究所, 公主岭, 136100
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2017 年, 第 15卷, 第 115 篇   
收稿日期: 2016年12月23日    接受日期: 2017年03月06日
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摘 要

本研究采用测序法、酶切扩增多态性序列(CAPS)和竞争性等位基因特异性PCRKASP)法对大豆Dt1基因的4SNP进行分型,旨在从准确性、稳定性、耗时和成本4个角度,对上述3种分型方法进行比较。结果表明3SNP分型方法均可对大豆Dt1基因进行分型,但准确性存在差异,测序法的准确率最高(100%),其次为KASP法(94.3%),CAPS法较低(89.6%);从稳定性来看,测序法最稳定,KASP法次之,CAPS法最差;从耗时来看,KASP最省时,其次是测序法,CAPS最耗时;在成本上,相比其他两种方法,KASP法最经济。在具备相关仪器设备的条件下,KASP大豆快速、高效的SNP分型方法

关键词
SNP分型; Dt1;CAPS; KASP
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《分子植物育种》印刷版
• 第 15 卷
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