研究报告/Research Report

乌拉尔图小麦叶绿体RNA编辑位点的预测与鉴定  

葛玲巧1 , Farhana Kumbhar1 , 赵贤1 , 王萌1 , 王莎1 , 宋卫宁1,2 , 聂小军1,2*
1西北农林科技大学, 农学院, 杨凌, 712100;
2旱区作物逆境生物学国家重点实验室,杨凌, 712100
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2017 年, 第 15卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2016年10月20日    接受日期: 2016年11月21日    发表日期: 2016年12月15日
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摘 要

RNA编辑指在RNA水平分子发生的碱基的改变或修饰,从而引起其所携带的遗传信息发生改变的过程。作为一种重要的转录后水平调控方式,RNA编辑在高等植物的生物发育、逆境响应以及细胞器生物合成等方面具有重要作用。为了解乌拉尔图小麦叶绿体基因组RNA编辑的组成和特点,本试验利用生物信息学预测结合RT-PCR的方法对乌拉尔图小麦叶绿体的RNA编辑位点进行了预测与分析。生物信息学分析发现在76个蛋白质编码基因中,15个基因发生了RNA编辑现象,共计33个胞嘧啶(C)到尿嘧啶(U)的变化,其中ndhB基因发生的编辑位点最多;然后,随机选取5个基因进行了试验验证,验证了预测的准确性;进一步对这个5个基因编辑后其蛋白二级结构和跨膜结构域进行了预测,发现编辑后所有基因的二级结构均发生了改变,而只有ndhB的跨膜结构域发生了改变;最后,比较了乌拉尔图小麦与其他5个麦类作物叶绿体RNA编辑位点的异同,发现了叶绿体编辑位点在麦类作物中具有较强保守性,同时也发现了个别物种特异的编辑位点。本研究为进一步研究乌拉尔图小麦叶绿体RNA编辑的生物学功能提供帮助,为从RNA编辑视角揭示小麦的起源进化提供了重要参考。

关键词
乌拉尔图小麦;叶绿体;RNA编辑;RT-PCR
《分子植物育种》印刷版
• 第 15 卷
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