亚麻荠NBS类抗病基因家族的鉴定与分析  

孙岩 , 刘宝玲 , 苑丽霞 , 薛金爱 , 贾小云 , 李润植
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2017 年, 第 15卷, 第 0 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要
NBS类抗病基因(nucleotide-binding site)是植物中最大的一类抗病基因。亚麻荠(Camelina sativa)是一种新型能源及特用油料作物,抗病、虫、杂草及逆境能力极强。然而,有关其抗性分子机理鲜有报道。本研究采用NB-ARC标准结构域的HMM(Hidden Markov Model)模型,对亚麻荠本地蛋白质数据库进行检索分析,在全基因组水平上鉴定NBS类抗病基因。结果表明亚麻荠基因组共有472个NBS类抗病基因,分布于17条染色体上,56%的基因成簇分布。所有串联重复基因也都以基因簇的形式出现,这表明串联重复有利于基因簇的形成。系统发生树分析显示TIR-NBS- LRR(TNL)和CC-NBS- LRR (CNL)两类亚家族的抗病基因可能在进化过程中遵循不同的进化路径,导致其在应对病原菌侵染时发挥不同的功能。本研究发现将为鉴定新的植物抗病基因和解析亚麻荠高抗病机制提供科学参考。
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