研究报告/Research Report

金花茶CnBCH基因cDNA全长克隆及生物信息学分析  

周兴文* , 周银慧 , 赵英 , 朱宇林
玉林师范学院生物与制药学院, 玉林, 537000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14卷, 第 74 篇   
收稿日期: 2016年08月30日    接受日期: 2016年09月13日    发表日期: 2016年09月26日
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摘 要

利用CODEHOP和RACE方法,从珍稀观赏植物金花茶(Camellia nitidissima)花瓣中克隆得到了β-胡萝卜素环羟化酶(β-carotene hydroxylase, BCH)基因的cDNA全长,命名为CnBCH。碱基序列分析结果表明,该CnBCH基因全长1 089 bp,包含58 bp的5'非翻译区(untranslated regions, UTR)、105 bp的3' UTR和927 bp编码308个氨基酸的开放阅读框。生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白质为不稳定亲水性蛋白,分子量为34.42 kD,无信号肽,含有4个跨膜结构域,一个脂肪酸羟化酶超家族(FA_hydroxylase super family)功能结构域以及BCH功能结构域(PLN02601);CnBCH二级结构以α-螺旋为主,其次为无规则卷曲,β-折叠所占比例最少。氨基酸序列比对分析结果显示,CnBCH与茄科、蔷薇科等植物BCH蛋白同源性都在70%以上,与柿树(Diospyros kaki T.) BCH同源性最高。本研究为进一步了解CnBCH基因的功能及其在金花茶花瓣类胡萝卜素合成中的作用提供了帮助。

关键词
金花茶;β-胡萝卜素羟化酶;克隆
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《分子植物育种》印刷版
• 第 14 卷
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