张羽^1* , 李佼² , 席彦军² , 李秀峰² , 徐凯明³

1陕西理工大学生物科学与工程学院, 汉中, 723000;
2陕西省汉中市农业科学研究所, 汉中, 723000;
3陕西省汉中市职业技术学院, 汉中, 723000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14卷, 第 13 篇   
收稿日期: 2016年08月29日    接受日期: 2016年09月26日    发表日期: 2016年10月10日

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本研究的目的是比较EST-SSR，SRAP和SCoT标记在茶树资源研究中的可应用性，为茶树分子标记的选择与优化提供依据。本研究用6份有代表性的茶树资源，从中筛选出扩增条带清晰、多态性高的EST-SSR标记40对、SRAP标记40对、SCoT标记38个，对50份茶树材料的遗传多样性进行分析，重点比较了这3种分子标记的多态性条带比率(PPB)、多态性信息含量(PIC)、位点平均信息量(Ib_av)、有效多元比率(EMR)、引物解析强度(Rp)、标记指数(MI)等方面的差异。40对EST-SSR引物共检测到320个等位位点，平均为8.00个，引物PPB、PIC、EMR、Ib_av、Rp、MI值分别 94.06%、0.85、7.53、0.56、4.48、4.22。40对SRAP引物共检测到336个等位位点，平均为8.40个，引物PPB、PIC、EMR、Ib_av、Rp、MI值分别为89.88%、0.77、7.55、0.61、5.11、4.61。38个SCoT引物共检测到439个等位位点，平均为11.55个，引物PPB、PIC、EMR、Ib_av、Rp、MI值分别为90.66%、0.79、10.47、0.58、6.71、6.07。3种标记体系检测到的平均等位位点、EMR、Rp和MI值都表现为SCoT最高，其次为SRAP，再次为EST-SSR，而EST-SSR的PPB和PIC值最高，其次为SCoT，再次为SRAP。SCoT具有较高的标记效率，而EST-SSR标记具有丰富的位点多态信息。

茶树；EST-SSR； SRAP；SCOT,；多样性