1 中国热带农业科学院橡胶研究所, 儋州, 571737; 2 海南大学农学院, 海口, 5702082
作者
通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14卷, 第 50 篇
收稿日期: 2016年06月22日 接受日期: 2016年07月14日 发表日期: 2016年07月14日
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《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14卷, 第 50 篇
收稿日期: 2016年06月22日 接受日期: 2016年07月14日 发表日期: 2016年07月14日
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摘 要
为了揭示橡胶树生殖发育相关基因的表达变化情况,本研究以橡胶树热研7-33-97花序、雄蕊、雌蕊为试验材料,利用Illumina HiSeqTM 2000对早期发育的花序、雄蕊、及雌蕊进行RNA-Seq测序,共识别出30 164个长度大于200 bp的Unigenes,与其它物种的序列相似性进行比较,发现所得Unigenes 与麻疯树的Unigenes相似数量最多。进一步对测序所得Unigenes进行GO (Gene Ontology)功能显著性富集和Pathway显著性富集分析发现这些Unigenes具有对应的993种酶(Enzyme, EC)功能,并能关联到197条生物学通路(Pathway),相关Unigenes主要涉及到碳水化合物运输与代谢、膜转运代谢、以及能量代谢通路,由此推测碳水化合物合成与运输相关基因可能在橡胶树花器官发育过程中起重要调控作用。本研究通过对橡胶树花器官发育相关基因进行转录水平分析,为深入开展橡胶树生殖发育相关功能基因的克隆和功能验证提供了丰富的基因资源,并为揭示橡胶树生殖发育的分子调控机制奠定良好基础。
关键词
橡胶树;生殖发育;RNA-Seq;GO分析;代谢通路分析