文心兰EST-SSR标记的开发及其在遗传多样性分析中的应用  

林榕燕 , 钟淮钦 , 黄敏玲 , 罗远华
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14卷, 第 0 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要
利用NCBI数据库中文心兰EST的SSR位点,设计了20对EST-SSR引物,建立文心兰EST-SSR体系,并将筛选出的引物用于30个文心兰品种资源的亲缘关系研究。结果显示,对3183条文心兰EST进行搜索,共检索出274个SSR位点,检出率为8.6%。EST-SSR的主要重复类型为二核苷酸,占60.58%。利用筛选出的13对引物对30个文心兰品种资源进行PCR扩增,共有10对引物有多态性,多态性条带数在3~15个之间,平均每对引物扩增到10个多态性条带,各引物的多态性比率分布为75.00% ~100.00%,总的多态性比率为91.09%。对其聚类分析发现在遗传距离为0.548处30个文心兰品种分为7大聚类群,其中‘南茜-1’和‘黄金3号’的亲缘关系最近。
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