陆梦婷¹ , 周媛媛¹ , 吕建兵¹ , 王付康¹ , 温永强¹ , 秦少伟¹ , 赵利峰^{1,2 *}

１塔里木大学生命科学学院, 阿拉尔, 843300;
2塔里木大学塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室, 阿拉尔, 843300
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14卷, 第 20 篇   
收稿日期: 2016年04月22日    接受日期: 2016年05月20日    发表日期: 2016年06月16日

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长非编码RNA (long non-coding RNA, lncRNA)是真核生物中广泛存在的一类转录本超过200 nt不编码蛋白质的RNA，参与干细胞维持、胚胎发育、细胞分化、细胞生长、细胞凋亡、代谢、信号传导以及免疫应答等生理或病理过程的调控。本研究结合植物基因组特点以及高通量RNA测序数据，采用生物信息学手段建立并优化了一套植物lncRNA筛选和鉴定的方法。利用此方法在胡杨异形叶发生的138845个RNA-Seq测序数据中，筛选并鉴定了2448个参与胡杨异形叶发生的lncRNA，并进一步对其功能进行预测和分析，为研究胡杨异形叶生长发育特性及最终揭示叶形发育的分子机制提供资料和理论帮助。

长链非编码RNA；胡杨；异形叶；高通量RNA测序；生物信息学