研究报告/Research Report

运用SLAF-seq技术构建水稻高密度遗传图谱  

彭强1,* , 叶生鑫2,* , 黄龙3 , 张大双1 , 刘颖2 , 吴健强1 , 张玉珊4 , 朱速松1,2
1 贵州省水稻研究所, 贵阳, 550006; 2 贵州师范大学生命科学学院, 贵阳, 550001; 3 北京百迈客生物科技有限公司, 北京, 101300; 4 贵州省生物技术研究所, 贵阳, 550006
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作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14卷, 第 16 篇   
收稿日期: 2016年03月11日    接受日期: 2016年04月12日    发表日期: 2016年04月12日
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摘 要

对精细定位某一特定性状位点来说,高密度遗传图谱是一个非常实用的工具。本研究以水稻品种V20B/CPSLO17组合衍生的150份重组自交家系作为作图群体,利用特定位点扩增长度测序(SLAF-seq)技术,一种基于下一代测序技术进行大规模开发SNP和基因型分析的高通量新策略,开发SLAF标签和构建水稻高密度遗传图谱。我们共检测到67 017个高质量的SLAF标签,其中多态性SLAF有15 853个,符合构建高质量遗传图谱使用要求的多态性SLAF标签有8657个。最终成功构建了一个包含12个连锁群,8 602个上图标记,总图距为2 508.65 cM,标记间平均距离为0.29 cM的高密度遗传图谱,该图谱可用于重要农艺性状QTL定位。

 

关键词
水稻;遗传图谱;特定位点扩增片段;作图群体
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《分子植物育种》印刷版
• 第 14 卷
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