研究报告/Research Report
运用SLAF-seq技术构建水稻高密度遗传图谱 
彭强1,* 
,
叶生鑫2,* ,
黄龙3 ,
张大双1 ,
刘颖2 ,
吴健强1 ,
张玉珊4 ,
朱速松1,2 
,
叶生鑫2,* ,
黄龙3 ,
张大双1 ,
刘颖2 ,
吴健强1 ,
张玉珊4 ,
朱速松1,2
1 贵州省水稻研究所, 贵阳, 550006; 2 贵州师范大学生命科学学院, 贵阳, 550001; 3 北京百迈客生物科技有限公司, 北京, 101300; 4 贵州省生物技术研究所, 贵阳, 550006
* 同等贡献作者
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14卷, 第 16 篇
收稿日期: 2016年03月11日 接受日期: 2016年04月12日 发表日期: 2016年04月12日
* 同等贡献作者
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14卷, 第 16 篇
收稿日期: 2016年03月11日 接受日期: 2016年04月12日 发表日期: 2016年04月12日
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摘 要
对精细定位某一特定性状位点来说，高密度遗传图谱是一个非常实用的工具。本研究以水稻品种V20B/CPSLO17组合衍生的150份重组自交家系作为作图群体，利用特定位点扩增长度测序(SLAF-seq)技术，一种基于下一代测序技术进行大规模开发SNP和基因型分析的高通量新策略，开发SLAF标签和构建水稻高密度遗传图谱。我们共检测到67 017个高质量的SLAF标签，其中多态性SLAF有15 853个，符合构建高质量遗传图谱使用要求的多态性SLAF标签有8657个。最终成功构建了一个包含12个连锁群，8 602个上图标记，总图距为2 508.65 cM，标记间平均距离为0.29 cM的高密度遗传图谱，该图谱可用于重要农艺性状QTL定位。
关键词
水稻；遗传图谱；特定位点扩增片段；作图群体
