赵芹¹ , 谢大森² , 何晓明² , 江彪² , 罗少波² , 彭庆务² , 陈俊秋²

1江苏省农业科学院植物保护研究所, 南京, 210014
2广东省农业科学院蔬菜研究所, 广州, 510640
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2016年03月01日    接受日期: 2016年03月23日    发表日期: 2016年08月28日

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推荐引用：

Zhao Q., Xie D.S., He X.M., Jiang B., Luo S.B., Peng Q.W., and Chen J.Q., 2016, Characterization analysis of reverse transcriptase of LINE retrotransposons in Chieh-qua mutants susceptible and resistant to fusaric acid, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 14(8): 1986-1994 (赵芹, 谢大森, 何晓明, 江彪, 罗少波, 彭庆务, 陈俊秋, 2016, 节瓜抗感镰刀菌酸突变体LINE逆转座子RT序列特征分析, 分子植物育种, 14(8): 1986-1994)

根据LINE逆转座子逆转录酶(RT)保守序列设计简并引物，PCR扩增节瓜gDNA，获得580 bp左右目的片段；PCR产物克隆测序后经相关生物信息学软件分析，获得41条来自感枯萎病材料及其抗性突变体的RT序列。感、抗材料的序列长度变化范围分别为548~590 bp与573~590 bp，存在明显缺失突变，核苷酸序列相似性分别为73.6%~98.9%与46.1%~99.3%；核苷酸序列聚类分析分为5个家族，家族I包含29个序列，为节瓜LINE逆转座子主要家族成员。对推导氨基酸序列分析发现，感、抗材料分别包含25个与4个保守氨基酸，抗性突变体半保守氨基酸数目略少，氨基酸序列相似性分别为53.5%~100%与10.3%~100%；与抗性突变体相比，感病材料终止密码子突变发生率较高(23条, 100%)，移码突变生率略低(11条, 47.82%)；仅发现1条抗性突变体序列具转录活性。两种材料均存在较高缺失突变、终止密码子突变与移码突变发生率，表现高度异质性。将节瓜RT序列与已知物种相应序列构建系统发育进化树，表明节瓜LINE逆转座子RT序列较保守，与拟南芥、葡萄、李等亲缘关系较近。

节瓜；抗感镰刀菌酸突变体；LINE逆转座子；逆转录酶；比较分析