研究报告/Research Report

紫薇叶片转录组分析及叶绿素和类胡萝卜素等途径基因的鉴定  

王淑安1,2 , 王鹏2 , 张振宇2 , 李亚2 , 尹增芳1
1 南京林业大学生物与环境学院, 南京, 210037;
2 江苏省中国科院植物研究所, 南京, 210014
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14卷, 第 0 篇   
收稿日期: 2016年01月21日    接受日期: 2016年02月24日
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摘 要

应用新一代高通量测序技术,对紫薇金叶突变体的叶片进行转录组测序和生物信息学分析。本研究中共组装获得45 308条unigenes,平均长度987.51 bp。21 339 (47.10%)条可以匹配到蛋白数据库获得注释信息。Unigenes在各数据库中注释的基因数分别为:在COG数据库中有11 512 (25.41%)条,在GO数据库中有12 196 条(26.92%),在KEGG数据库中有5 709条(27.73%)。通过与NCBI和Uniprot蛋白数据库的比对,共22条叶绿素代谢相关基因和17条类胡萝卜素代谢相关基因被鉴定出来,为突变体基因的筛选提供了候选基因。

关键词
紫薇;突变体;叶绿体;转录组
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《分子植物育种》印刷版
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