郝西 , 理向阳 , 腊贵晓 , 代丹丹 , 杨铁钢

河南省农业科学院经济作物研究所, 农业部中原地区作物栽培科学观测实验站, 郑州, 450002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13卷, 第 17 篇   
收稿日期: 2015年06月03日    接受日期: 2015年06月29日    发表日期: 2015年10月08日

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扩展蛋白(expansins)是植物细胞壁的重要组成部分，能够引起细胞壁组分间松驰和细胞壁柔韧性增加，在植物的许多生长发育过程中发挥作用。为了揭示黄瓜扩展蛋白基因家族的功能，本研究利用全基因组测序数据鉴定黄瓜扩展蛋白基因家族，分析其结构特征及系统发育关系。黄瓜基因组测序数据分析显示，黄瓜扩展蛋白基因家族包含35个成员，包括A(21)、B(3)、LA(9)和LB(2)4个亚家族，分布在黄瓜7条染色体上。扩展蛋白氨基酸长度范围为206-295，编码蛋白质具有保守的结构域，蛋白质亚细胞定位预测结果表明所有蛋白均定位于细胞外。基因结构分析表明，黄瓜扩展蛋白四个亚家族的平均内含子数目分别为A类1.9个，B类3个，LA类3.8个和LB类3.5个。基因表达分析发现，该家族基因在黄瓜雌雄花蕾及果实发育过程中表达丰度较高。本研究分析了黄瓜扩展蛋白基因家族的基本信息，可为深入研究其扩展蛋白基因的分子进化与生物学功能奠定基础。

黄瓜；扩展蛋白；生物信息学；基因家族