研究报告/Research Report

番茄CBL家族基因的鉴定和遗传进化分析  

刘淑梅1 , 王施慧1 , 刘明毓2 , 纪复勤3 , 李利斌1 , 侯丽霞1
1山东省农业科学院蔬菜花卉研究所/山东省设施蔬菜育种工程技术研究中心/国家蔬菜改良中心山东分中心, 济南, 250100;
2山东省东平县种子公司, 东平, 271500;
3山东省宁阳县万丰种业有限公司, 宁阳, 271400
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13卷, 第 15 篇   
收稿日期: 2015年04月15日    接受日期: 2015年05月14日    发表日期: 2015年10月22日
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摘 要

植物CBL基因在逆境应答过程具有重要功能,但在番茄中缺乏相关报道。本研究利用生物信息学的方法从番茄基因组中鉴定出13个CBL基因,并对它们的基因组分布、分子特征、遗传进化以及顺式元件等进行了分析。结果发现,番茄CBL基因在基因组中的分布是不均匀的,外显子数大多为8或者9,编码区序列大小在561bp和774bp之间。在进化上番茄CBL基因分为两个不同的类群;它们编码的蛋白除了一个预测定位在胞外基质中,其余定位在细胞的不同部位;在番茄CBL基因的上游序列中存在几个或者多个应答不同逆境和植物激素的顺式元件,而且不同成员含有的顺式元件的种类和数目各不相同。上述分析显示番茄CBL可能参与多种生物学过程,而且不同成员存在功能上的分化。本研究结果可为进一步研究番茄CBL基因的功能提供有益参考。

关键词
番茄;类钙调磷酸酶B亚基蛋白;序列特征;遗传进化
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《分子植物育种》印刷版
• 第 13 卷
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