孙建¹ , 涂玉琴¹ , 颜廷献¹ , 乐美旺¹ , 饶月亮¹ , 雷刚^2,3 , 颜小文¹ , 周红英¹

1 江西省农业科学院作物研究所，国家油料改良中心南昌分中心，南昌，330200；
2 江西省农业科学院蔬菜花卉研究所，南昌，330200；
3 江西农业大学农学院，南昌，330045
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13卷, 第 26 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.001857
收稿日期: 2015年03月24日    接受日期: 2015年04月30日    发表日期: 2015年06月27日

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推荐引用：

Sun J., Tu Y.Q., Yan T.X., Le M.W., Rao Y.L., Lei G., Yan X.W., and Zhou H.Y., 2015, Orthogonal optimization of RMAPD-PCR reaction system for sesame and its application, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 13(8): 1857-1866 (孙建, 涂玉琴, 颜廷献, 乐美旺, 饶月亮, 雷刚, 颜小文, 周红英, 2015, 芝麻RMAPD分子标记反应体系的正交优化及应用, 分子植物育种，2015年，13(8): 1857-1866)

 RMAPD是将RAPD和SSR相结合而开发的新型分子标记。本研究采用L₁₆(4⁵)正交设计试验和单因素试验相结合的方法，对影响芝麻RMAPD-PCR反应的模板DNA、Mg²⁺、dNTPs、引物和Taq聚合酶等因素进行了优化。结果表明，芝麻RMAPD-PCR的最佳反应体系(15 μL)为：模板DNA用量30 ng、Mg²⁺浓度2.0 mmol/L、dNTPs浓度0.3 mmol/L、RAPD引物浓度1.0 μmol/L、SSR引物浓度0.4 μmol/L和Taq聚合酶1.0 U。利用该PCR体系开展了芝麻遗传多样性分析和遗传群体多态性检测试验，21对随机引物组合在16个芝麻品种中共扩增DNA条带413条，每对引物扩增14~29条，平均19.7条，多态性比例为12.50%~62.96%，平均29.78%；RMAPD标记在F₂群体植株中出现了亲本位点的分离。研究结果表明，该RMAPD-PCR反应体系稳定、可靠，RMAPD标记是一种可以用于芝麻遗传多样性分析、遗传连锁图谱构建和分子标记辅助育种等研究的新技术。

芝麻；RMAPD；正交优化；单因素试验；应用