研究报告/Research Report

非洲水稻种质资源SSR指纹图谱的构建及遗传多样性分析  

黄瑞1,2 , 周雷2 , 何卫1,2 , 李三和2 , 陈志军2 , 刘凯2 , 闸雯俊2 , 杨国才2 , 焦春海2 , 游艾青2
1武汉大学研究生院, 武汉, 430072;
2粮食作物种质创新与遗传改良湖北省重点实验室, 湖北省农业科学院粮食作物研究所, 武汉, 430064
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13卷, 第 7 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.001476
收稿日期: 2015年02月26日    接受日期: 2015年04月06日    发表日期: 2015年05月25日
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推荐引用:

Huang R., Zhou L., He W., Li S.H., Chen Z.J., Liu K., Zha W.J., Yang G.C., Jiao C.H., and You A.Q., 2015, Establishment of SSR fingerprint map and analysis of genetic similarity among the germplasm resources of rice from africa, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 13(7): 1476-1486 (黄瑞, 周雷, 何卫, 李三和, 陈志军, 刘凯, 闸雯俊, 杨国才, 焦春海, 游艾青, 2015, 非洲水稻种质资源SSR指纹图谱的构建及遗传多样性分析, 分子植物育种, 13(7): 1476-1486)

摘 要

本研究利用均匀分布于水稻12条染色体上的36对SSR引物,以57份来自非洲和5份国内生产上的骨干品种为试验材料,进行遗传多样性分析和SSR指纹图谱的构建。结果表明:36对引物在供试材料中都具有多态性片段,共检测到192个等位基因,平均每位点5.3个等位基因;每个标记的多态性信息含量(PIC)为0.181~0.823,平均值为0.570,从中筛选出在供试材料中多态性好、扩增稳定、杂带少且PIC比较高的18个引物为核心标记构建指纹图谱。采用非加权类平均法进行聚类分析,结果显示:62个品种在相似系数0.66处分为籼、粳两亚种类群;聚类树形图也能比较好地划分品种的地理来源。以等位位点的纯合性为指标,54个品种具有稳定的遗传基础。研究结果有助于优异水稻资源的创新利用,辅助杂交育种中的亲本选配,扩大栽培稻遗传基础进而提高产量、改良品质和抗性。

关键词
种质资源;指纹图谱;遗传多样性分析;非洲
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《分子植物育种》印刷版
• 第 13 卷
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