吴宝美 , 吴婷 , 李柳茹 , 王斌斌^*

山西师范大学生命科学学院, 太原, 030000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2022年01月20日    接受日期: 2022年01月28日    发表日期: 2022年09月07日

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干旱和盐胁迫是影响水稻生长发育的主要环境因子，为了获得两种胁迫下共同差异表达基因，选取GEO 数据库干旱和盐胁迫两种处理条件下基于 GPL2025 平台的 7 个数据集，利用 GEO2R 进行相关差异基因分析和 Venn 分析法筛选干旱和盐胁迫下共同差异表达基因。结果表明：在所选数据集中，干旱和盐胁迫下共同差异表达基因共有 3 个，分别是编码 11 kD 胚胎发育晚期丰富蛋白基因 LOC_Os08g23870、脱水素Rab16B 样蛋白基因 LOC_Os11g26780 和一个未知功能蛋白基因 LOC_Os11g07911；基本性质预测分析显示3 个基因表达的蛋白质均具亲水性，且定位于细胞核，前两者较为稳定，后者不稳定；3 个基因的启动子序列区含有丰富的脱落酸应答元件和茉莉酸甲酯元件。水稻幼苗经干旱和盐胁迫处理后，幼苗叶片和根部均可检测到 LOC_Os08g23870、LOC_Os11g26780 和 LOC_Os11g07911 不同程度的上调表达，暗示这 3 个基因对水稻耐受干旱胁迫和盐胁迫具有重要的生物学意义。本研究为进一步探索 LOC_Os08g23870、LOC_ Os11g26780和 LOC_Os11g07911 功能以及培育抗旱耐盐种质材料提供了理论基础。

水稻；干旱胁迫；盐胁迫；GEO 数据库