王紫阳¹ , 成彦丽² , 殷云龙¹ , 於朝广¹ , 李火根²

1江苏省中国科学院植物研究所(南京中山植物园), 南京, 210014;
2南京林业大学, 南京, 210037
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13卷, 第 25 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.001631
收稿日期: 2015年01月27日    接受日期: 2015年03月01日    发表日期: 2015年05月15日

这是一篇《分子植物育种》印刷版的数字优先出版(Online Publishing in Advance)论文，如果需要下载阅读全文，请您订阅。
 

推荐引用：

Wang Z.Y., Cheng Y.L., Yin Y.L., Yu C.G., and Li H.G., 2015, The cross-family transferability of SSR markers developed from the transcriptome of Taxodium ‘Zhongshanshan 406’ and its application in genotypic assessment, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 13(7): 1631-1638 (王紫阳, 成彦丽, 殷云龙, 於朝广, 李火根, 2015, 中山杉EST-SSR引物通用性及基因分型检测, 分子植物育种, 13(7): 1631-1638)
 

为分析中山杉EST-SSR标记的跨科间通用性及其在基因分型中的应用效果，本研究利用从中山杉406 EST序列中开发的503对SSR引物，以中山杉302与墨西哥落羽杉2个亲本及其杂种F₁群体150个单株为材料，检测了该批引物在中山杉杂种子代群体基因分型中的应用潜力。同时，以杉科、柏科、松科、红豆杉科15属16种的DNA样品为材料，根据引物在中山杉中的检测结果，选取60对引物(15对多态性扩增, 15对单态扩增, 30对无扩增产物)，检测了该批引物跨科间的通用性。结果表明：503对引物中，17对(3.38%)引物在落羽杉属中多态性扩增，并能准确鉴别亲本及杂种F₁群体150个单株的基因型，表明该批SSR引物可有效用于中山杉基因分型分析。15对多态性引物在杉科、柏科、松科、红豆杉科中的通用率分别为60%~73.33%、26.67%~53.33%、46.67%和40%，其中10对(83.33%)在杉科扩增出多态，3对(37.5%)在柏科中扩增出多态。15对无多态性引物在上述4科中的通用率分别为20%~40%、0~20%、20%和0。此外，30对在中山杉中无扩增产物的SSR引物中，2对可在其他科属中有效扩增。本研究结果表明，该批SSR引物可应用于中山杉群体遗传结构分析，指纹图谱及遗传图谱构建等领域，并进一步讨论了该批引物在其它针叶树种中的应用潜力。

中山杉406；EST-SSR；通用性；基因分型