研究报告
辣椒 4CL 基因家族成员的鉴定与生物信息学分析 
何磊1 
,
严希1 ,
袁圆1 ,
余伟2 ,
李伟3 ,
赖卫1 ,
刘崇政1 ,
杨红1 
,
严希1 ,
袁圆1 ,
余伟2 ,
李伟3 ,
赖卫1 ,
刘崇政1 ,
杨红1
1贵州省辣椒研究所, 贵阳, 550009; 2 贵州省生物研究所, 贵阳, 550009; 3 贵州大学农学院, 贵阳, 550025
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 5 篇
收稿日期: 2021年12月21日 接受日期: 2022年01月06日 发表日期: 2022年04月28日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 5 篇
收稿日期: 2021年12月21日 接受日期: 2022年01月06日 发表日期: 2022年04月28日
© 2022 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要
4- 香豆酸：辅酶 A 连接酶(4-coumarate: CoA ligase, 4CL)基因家族调控植物木质素代谢、参与类黄酮和其他次生代谢产物合成。为了解辣椒 Ca4CL 基因家族的分子特性及生物学功能。本研究基于辣椒的全基因组测序结果鉴定 4CL 基因家族，并进行生物信息学分析。结果共鉴定获得 8 条辣椒 4CL 基因，不均匀的分布于基于 3、7、11 和 12 号染色体，其中 Ca4CL06 和 Ca4CL08 未锚定；辣椒 Ca4CL 的外显子数目在 5~6之间，基序分析结果保守；分析顺式作用元件发现，在辣椒 Ca4CLs 上游 2 000 bp 序列中存在多个响应元件，包括光、Me-JA、厌氧诱导、低温等响应元件。辣椒 4CL 基因家族表达分析发现 Ca4CL01 在根、茎、叶、果皮(开花期后 25 d, 绿果期,转色期, 转色 10 d)、胎座(转色期, 转色 5 d, 转色 10 d)中均无表达，其余 Ca4CLs表达具有较强组织特异性Ca4CL04 在叶、根、果皮等时期高表达。本研究为进一步分析 Ca4CLs 基因在生长发育、胁迫等条件下的功能和相应的信号转导途径提供了理论依据。
关键词
辣椒(Capsicum annuum)；4CL 基因家族；生物信息学分析；木质素
