大理大学药学院, 大理, 671000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 9 篇
收稿日期: 2021年10月21日 接受日期: 2021年11月06日 发表日期: 2023年03月28日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 9 篇
收稿日期: 2021年10月21日 接受日期: 2021年11月06日 发表日期: 2023年03月28日
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摘 要
为探究南欧大戟(Euphorbia peplus L.)叶绿体基因组序列特征及系统进化位置关系。本研究以南欧大戟总DNA为研究对象,利用Illumina HiSeq 2500高通量测序仪测定南欧大戟的叶绿体基因组序列,采用GetOrganelle进行完整叶绿体基因组的组装,并借助生物信息学工具进行基因组的注释分析、图谱构建和系统发育分析。结果表明南欧大戟叶绿体基因组全长159 466 bp,呈典型的四分体环状结构,包括一个大单拷贝区、一个小单拷贝区和两个反向互补重复区,其大小分别为89 398、17 802和26 133 bp,GC值为35.8%;共编码基因130个,其中包括8个rRNA基因、37个tRNA基因和85个蛋白编码基因。基于23种植物系统发育分析表明,南欧大戟与同亚科植物浆果乌桕的亲缘关系最近。本研究获取了南欧大戟的叶绿体基因组特征信息和系统发育位置,为该植物的资源开发、品种鉴定和遗传进化研究奠定了新的材料基础。
关键词
南欧大戟;叶绿体基因组;序列特征;系统发育分析