研究报告
欧李 AP2 基因家族的鉴定与表达分析 
张晓旭1 
,
郭彩珍1 ,
穆霄鹏1 ,
郭夕雯1 ,
王鹏飞1 ,
汪泽文2 ,
曹琴1 ,
杜俊杰1 
,
郭彩珍1 ,
穆霄鹏1 ,
郭夕雯1 ,
王鹏飞1 ,
汪泽文2 ,
曹琴1 ,
杜俊杰1
1 山西农业大学园艺学院, 太谷, 030801; 2 南京农业大学园艺学院, 南京, 210095
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 9 篇
收稿日期: 2021年10月20日 接受日期: 2021年10月25日 发表日期: 2022年09月21日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 9 篇
收稿日期: 2021年10月20日 接受日期: 2021年10月25日 发表日期: 2022年09月21日
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摘 要
| 本研究以欧李全基因组和转录组数据为基础，对欧李 AP2 家族基因进行鉴定。结果表明：AP2家族基因在欧李中有 17 个成员，都具有两个 AP2 结构域。氨基酸数在 356~854 之间，分子量在 40 092.00~93 434.48 kD 之间，等电点为 4.81~9.37 之间，无规则地分布在 5 条染色体上。二级结构多为无规则卷曲。根据亚细胞定位显示：ChAP2-7 存在于细胞质中，ChAP2-3、ChAP2-6、ChAP2-11 和 ChAP2-15 存在于细胞核中。聚类分析将其分为三大类：AP2、euANT、basal ANT，其中，ChAP2-14 与 At5g67180，ChAP2-16 与At2g28550，ChAP2-10 与 At3g54320 等亲缘关系最近。综合来看，AP2 家族的 17 个基因在不同的组织和不同的品种间表达差异较大。AP2-4 和 AP2-6 在不同组织均有表达，AP2-2，AP2-3 等基因在不同组织均不表达。AP2-4 和 AP2-6 在‘农大 4 号’果实中表达较高，在‘农大 5 号’果实中几乎不表达。本研究结果为进一步研究欧李 AP2 基因家族的生物学功能与利用提供参考。 |
| 本研究以欧李全基因组和转录组数据为基础，对欧李 AP2 家族基因进行鉴定。结果表明：AP2家族基因在欧李中有 17 个成员，都具有两个 AP2 结构域。氨基酸数在 356~854 之间，分子量在 40 092.00~93 434.48 kD 之间，等电点为 4.81~9.37 之间，无规则地分布在 5 条染色体上。二级结构多为无规则卷曲。根据亚细胞定位显示：ChAP2-7 存在于细胞质中，ChAP2-3、ChAP2-6、ChAP2-11 和 ChAP2-15 存在于细胞核中。聚类分析将其分为三大类：AP2、euANT、basal ANT，其中，ChAP2-14 与 At5g67180，ChAP2-16 与At2g28550，ChAP2-10 与 At3g54320 等亲缘关系最近。综合来看，AP2 家族的 17 个基因在不同的组织和不同的品种间表达差异较大。AP2-4 和 AP2-6 在不同组织均有表达，AP2-2，AP2-3 等基因在不同组织均不表达。AP2-4 和 AP2-6 在‘农大 4 号’果实中表达较高，在‘农大 5 号’果实中几乎不表达。本研究结果为进一步研究欧李 AP2 基因家族的生物学功能与利用提供参考。 |
关键词
欧李；AP2 基因家族；鉴定；表达分析
