研究报告

甘薯水通道蛋白基因家族的全基因组鉴定和表达分析  

宋小锋 , 原增艳
新乡医学院三全学院生命科学技术学院, 新乡, 453003
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2021年10月03日    接受日期: 2021年10月18日    发表日期: 2022年09月14日
© 2022 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要

水通道蛋白(aquaporin, AQP)基因家族是植物必需的一类膜蛋白,在植物生长、发育和胁迫条件下具有多种功能。本研究通过搜索甘薯(Ipomoeabatatas)基因组,并从中挖掘水通道蛋白家族基因,进一步对该家族蛋白质的理化性质、系统发育、基因结构、互作网络和组织及干旱胁迫下的表达进行分析。结果表明:甘薯基因组中共有 46 个水通道蛋白编码基因,这些基因通过系统发育分析分为四个亚家族(PIP; TIP; NIP;SIP)。甘薯 AQP 基因存在于除 6 号染色体外的所有甘薯染色体上,11 号染色体上最多有 7 个基因,3、4、10号染色体上最少有 1 个基因。基因重复分析表明,甘薯 AQP 基因家族的扩增可能是由于大片段重复和串联重复。基于转录组的组织及干旱条件下表达特性分析表明,甘薯 AQP 基因呈现出较强的组织差异性表达,且大部分的 AQP 基因在干旱胁迫后表达量下调。甘薯 AQP 在不同植物部位和胁迫条件下的表达谱为了解甘薯不同渗透胁迫条件下 AQP 的参与提供了有价值的数据。本研究不仅为进一步研究甘薯 AQP 作为甘薯耐旱性遗传改良研究的候选基因提供了参考和资源,也提高了我们对植物水通道蛋白进化的了解。

 

关键词
水通道蛋白;甘薯;全基因组鉴定;进化分析;表达
《分子植物育种》印刷版
• 第 20 卷
阅览选项
. 全文 PDF
. 全文 HTML
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
宋小锋
.
原增艳
相关论文
.
水通道蛋白
.
甘薯
.
全基因组鉴定
.
进化分析
.
表达
服务
. 发表评论