苏江 , 郭天玮 , 季孔庶

南京林业大学南方现代林业协同创新中心, 南京, 210037
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13卷, 第 23 篇   
收稿日期: 2015年01月06日    接受日期: 2015年02月16日

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推荐引用：

Su J., Guo T.W., and Ji K.S., 2015, Cloning and coding protein structure prediction of TIR1 gene from Pinus massoniana, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 13(6): 1355-1362 (苏江，郭天玮，季孔庶，2015，马尾松PmTIR1基因的克隆及编码蛋白质的结构预测，分子植物育种，13(6): 1355-1362)

TIR1 (transport inhibitor response 1)基因在生长素信号转导途径中发挥重要作用。本研究采用PCR技术和RACE技术，利用Primer Premier5进行引物设计，从马尾松中克隆出TIR1基因的全长cDNA序列，命名为PmTIR1。此cDNA全长2 446 bp，包括1 725 bp完整的ORF，能够编码含有574个氨基酸的蛋白，此蛋白相对分子质量为64 240.3 u，等电点为6.76。利用ClustalX、ANTHEPROT和DNAMAN等软件分析PmTIR1序列及其编码的氨基酸序列，结果表明：马尾松PmTIR1蛋白氨基酸序列与火距松TIR1蛋白同源性高达99％，PmTIR1蛋白含有F-box结构域和多个LRR结构域；PmTIR1蛋白的F-box结构域可能与SCFTIR1中SKP1结合，它符合F-box家族的特点。利用实时定量技术得知PmTIR1在马尾松嫩根、嫩茎、嫩叶中都有表达，在嫩叶中表达量最高、嫩根中次之、嫩茎中最低。本研究可为生长素调控马尾松生长发育相关机理提供理论依据。

马尾松；生长素；TIR1 (transport inhibitor response1)；序列分析；结构预测