1 铜仁学院, 贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室, 铜仁, 554300; 2 贵州大学生命科学学院, 山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室, 山地生态与农业生物工程协同创新中心, 贵阳, 550025; 3 楚雄医药高等专科学校, 楚雄, 675000
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 41 篇
收稿日期: 2021年09月12日 接受日期: 2021年09月20日 发表日期: 2022年08月05日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 41 篇
收稿日期: 2021年09月12日 接受日期: 2021年09月20日 发表日期: 2022年08月05日
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摘 要
利用 NCBI 数据库数据,以绶草叶绿体 matK 序列和核基因 ITS 序列为主要研究对象,对绶草的遗传多样性及地理分布格局进行讨论分析,以期为绶草优良种质资源的遗传多样性评价提供有价值的参考。结果表明:绶草的 matK 序列比对后长度为 512 bp,G+C 含量 32.4%,A+T 含量 67.7%,序列碱基组成具有明显的 A/T 偏好性,共检测到 7 个单倍型,总单倍型多样性 Hd 为 0.644,总核苷酸多样性(π)为 0.003 16。绶草的 ITS 序列比对后长度为 441 bp,G+C 含量 55.3%,A+T 含量 44.8%,共检测到 15 个单倍型,总单倍型多样性 Hd 为 0.877,总核苷酸多样性(π)为 0.007 18,遗传分化系数 Gst<Nst (Gst=0.39<Nst=0.64;Gst=0.26<Nst=0.50),说明绶草具有明显的谱系地理分布格局,基因流较低(Nm=0.14, Nm=0.25),失配分析的观测值曲线与期待值曲线都呈下降趋势并且呈现多峰,结合中性检测结果发现绶草物种居群保持稳定,没有发生过近期扩张现象。本研究得出印度、韩国、日本和歌县,中国喜马拉雅山脉地区遗传多样性较高,推测在第四纪冰期时绶草在印度、中国、朝鲜、日本等均可能存在冰期避难所。
关键词
绶草(Spiranthes sinensis);NCBI;谱系地理学;遗传多样性