1 海南大学, 海南省热带生物资源可持续利用重点实验室, 海口, 570228; 2 海南大学热带作物学院, 海口, 570228; 3 海南大学生命科学与药学院,
海口, 570228
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 3 篇
收稿日期: 2021年07月29日 接受日期: 2021年08月13日 发表日期: 2023年02月27日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 3 篇
收稿日期: 2021年07月29日 接受日期: 2021年08月13日 发表日期: 2023年02月27日
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摘 要
Gretchen hagen 3(GH3)属于植物生长素早期响应基因,通过控制生长素的稳态对植物生长发育和逆境胁迫响应起着重要作用,至今未见关于木薯GH3基因家族的报道。本研究通过生物信息学方法,在木薯全基因组数据中鉴定获得12个木薯GH3家族基因(MeGH3.1~MeGH3.12),其氨基酸分子量为44.53~ 69.92 kD,等电点范围为 5.18~ 6.73,木薯所有GH3家族均含有motif 1、2、3、4和8保守基序,具有3~4个外显子;根据系统进化关系可将MeGH3家族成员分为3组;木薯MeGH3基因不均匀分布在7条染色体上,共线性分析木薯MeGH3基因可能来源于串联重复事件;启动子分析结果表明,MeGH3基因含有多种激素和胁迫响应顺式作用元件;表达分析发现,MeGH3基因在不同组织中表达量明显差异,绝大多数MeGH3基因受病原菌侵染诱导表达。综合考虑,MeGH3.4和MeGH3.5可作为研究木薯抗病机制的候选基因。
关键词
木薯;GH3;基因家族;表达分析;系统进化;生长素响应