研究报告/Research Report

小黑杨抗寒转录因子PnsICE1基因克隆与生物信息学分析  

王艳敏 , 白卉 , 张妍妍
1 黑龙江省林业科学研究所, 哈尔滨, 150081;
2 黑龙江省速生林木培育重点实验室, 哈尔滨, 150081
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13卷, 第 23 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.000871
收稿日期: 2015年01月13日    接受日期: 2015年02月28日    发表日期: 2015年03月29日
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摘 要

ICE1基因是能够编码类似MYC的bHLH转录因子,在低温条件下能够特定地结合CBF3基因启动子中的顺式作用元件,以诱导这个基因所能调控的下游基因的表达。本研究以4℃低温处理24 h的小黑杨(Populus simonii×P. nigra) cDNA为模板,克隆ICE1基因,命名为PnsICE1。其cDNA长1 650 bp,可编码549个氨基酸。利用Phytozome数据库、NCBI网站、ProtParam、ProtScale、Pfam27.0和MEGA软件对小黑杨ICE1基因进行生物信息学分析,BLAST分析表明,cDNA序列及其推导的氨基酸序列均与毛果杨(P. trichocarpa)和甜杨(P. suaveolens) ICE1存在着较高的同源性,预示所获得的cDNA可能是小黑杨ICE1基因(PnsICE1)。

关键词
小黑杨;转录因子;抗寒性;ICE1
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《分子植物育种》印刷版
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