张思思 , 姚军 , 尹秋 , 聂超仁 , 王建强^*

武汉市园林科学研究院, 武汉, 430081
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 28 篇   
收稿日期: 2021年06月25日    接受日期: 2021年07月02日    发表日期: 2022年08月03日

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悬铃木为悬铃木科(Platanaceae)悬铃木属(Platanus)植物的统称，本研究利用 MISA 软件对二球悬铃木(Platanus acerifolia)转录组测序获得的 47 161 条 Unigene 进行了 SSR 位点搜索及特征分析，结果发现 SSR位点 15 262 个，SSR 的出现频率为 32.36%，SSR 的平均距离为 3.94 kb。其中单核苷酸重复所占比例最高，占总 SSR 位点的 42.65%，其次是二核苷酸和三核苷酸重复类型，分别占 34.17%和 21.27%。本研究使用 Primer 3软件对二球悬铃木转录组测序得到的 15 262 个 SSR 位点分别设计 3 对引物，筛选 60 对引物进行扩增验证，其中 46 对引物扩增获得预期条带。以 10 个悬铃木无性系为材料，发现其中 7 对引物的扩增产物表现出多态性。以上结果表明，基于悬铃木转录组序列的 SSR 标记开发切实可行，本研究开发的 SSR 标记可用于悬铃木种群遗传多样性检测和种间亲缘关系鉴定。

悬铃木；转录组；SSR；引物