王宇飞¹ , 江媛¹ , 杨成金² , 王婧^1,3 , 徐志超³ , 段宝忠^1*

1大理大学药学院,大理, 671000; 2云南白药集团中药资源有限公司,昆明, 650500; 3东北林业大学生命科学院,哈尔滨, 150040
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 17 篇   
收稿日期: 2021年06月21日    接受日期: 2021年06月30日    发表日期: 2022年01月17日

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为探究滇重楼叶绿体基因组功能、结构及密码子使用偏好性，本研究对滇重楼叶绿体基因组进行测序、组装，并对其结构、基因功能、密码子偏好性、影响因素、最优密码子进行分析。结果显示，滇重楼叶绿体基因组具有典型的四分体结构，全长 164 130 bp，平均 GC含量为 37.00%，LSC、IRs和 SSC长度分别为 84 363、33 433和 12 901 bp；注释得到 133个功能基因，其中包括 87个蛋白质编码基因，8个核糖体 rRNA基因和38个 tRNA基因。密码子偏好性分析结果显示，滇重楼叶绿体基因组密码子使用模式主要受到自然选择因素的影响，最优密码子多以 Ａ 或 U碱基结尾。本研究为进一步探讨滇重楼异源表达及基因功能提供了一定参考，也为在分子水平上研究重楼属植物的系统进化提供了相应的理论基础。

滇重楼；叶绿体基因组；密码子偏好性；最优密码子