王强¹ , 胡金鹏¹ , 潘雅清³ , 张亚琪¹ , 彭伊扬¹ , 李洪明¹ , 康鹏^1,2*

1 北方民族大学生物科学与工程学院, 银川, 750021; 2 北方民族大学, 国家民委黄河流域农牧交错区生态保护重点实验室, 银川, 750021; 3 宁夏大学农学院, 银川, 750021
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《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2021年06月03日    接受日期: 2021年06月11日    发表日期: 2022年02月17日

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蒙古岩黄芪(Hedysarum mongolicum Turcz.)是中国西北干旱半干旱地区防风固沙、保持水土的重要物种，目前其转录组学和遗传学研究很少。本研究利用 PacBio Sequel 测序平台对蒙古岩黄芪在 -0.5 MPa干旱胁迫下的植株转录组进行全长测序，在对转录本进行聚类纠错后利用 NR、GO、KEGG、Pfam、eggNOG、Swiss-Prot 6 个数据库进行功能注释，分别有 8 202 (NR)、6 290 (GO)、4 087 (KEGG)、7 182 (Pfam)、8 108 (eggNOG)和 7 433(Swiss-Prot)个转录本获得功能注释。通过简单序列重复(Simple sequence repeat)分析，共生成 20 G 数据，并根据 ROI 是否含有引物和嵌合体进行分类，得到 145 462 条转录本，其中非全长转录本的有19 962 (13.72%)，全长转录本为 125 493 (85.16%)，平均序列长度为 2 322 bp；Quiver 校正得到 15 690 个 Isforms，准确度大于 99%的高质量一致性序列有 15 688 条。在高质量的转录本中，共有 4 717 个 SSR 位点，单核苷酸序列占 31.20%，1~3 个核苷酸重复序列占主导位置，占总 SSR 位点的 91.99%。研究结果增加了对蒙古岩黄芪遗传特性的认知，为下一步开展全长基因克隆、基因表达谱分析以及功能基因的挖掘与利用等提供参考。

蒙古岩黄芪；干旱胁迫；全长转录组；SSR 分析