陶鹏 , 钟新民 , 李必元 , 王五宏 , 岳智臣 , 雷娟利

浙江省农业科学院蔬菜研究所, 杭州, 310021
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13卷, 第 17 篇   doi: 10.13271/j.mpb.013.001072
收稿日期: 2014年10月24日    接受日期: 2014年12月24日    发表日期: 2015年01月08日

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推荐引用：

Tao P., Zhong X.M., Li B.Y., Wang W.H., Yue Z.C., and Lei J.L., 2015, Prediction and frequency analysis of ploy(A) sites of BoKIN1 gene of cabbage (brassica oleracea L.), Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 13(5): 1067-1071 (陶鹏，钟新民，李必元，王五宏，岳智臣，雷娟利，2015，甘蓝BoKIN1基因的ploy(A)位点的预测及其频率分析，分子植物育种，13(5): 1067-1071）

多聚腺苷酸化(Polyadenylation)是真核生物中一种重要的pre-mRNA加工机制，是mRNA成熟的一个必经过程。为了解甘蓝BoKIN1基因的多聚腺苷酸化加工情况，本研究从甘蓝全基因组数据库中下载得到BoKIN1基因序列，并利用生物信息学手段分析了BoKIN1的基因结构和基因表达。研究结果显示：BoKIN1基因在花器官中表达最高；然后基于EST文库发现了3个ploy(A)位点，并计算了这些ploy(A)位点在pre- mRNA加工过程中被选择的大致频率情况，结果显示BoKIN1基因在pre-mRNA加工过程中至少有6个ploy(A)位点可供选择加尾，其中AP4位点被选择加尾的频率最高，其次是AP5位点。因此选择AP4位点加尾后形成的mRNA是转录后加工的主要产物。通过本研究我们确定了甘蓝类BoKIN1基因6个选择性加尾位点及其3'UTR的主要产物和次要产物，可对于未来进一步利用这些3'UTR奠定基础。

甘蓝；BoKIN1；表达；ploy(A)位点；ploy(A)频率