江思容¹ , 夏志强¹ , 张辰笈¹ , 赵龙¹ , 鲍宇婷¹ , 付瑜华² , 杨龙² , 罗春芳² , 饶萍² , 欧珍贵^2* , 邹枚伶^1*

1 海南大学热带作物学院, 海口, 570228; 2 贵州省亚热带作物研究所, 兴义, 562400
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2021年04月11日    接受日期: 2021年04月19日    发表日期: 2022年08月01日

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芭蕉芋是一种富含淀粉的具有较高经济价值的多用途作物，而美人蕉属于常见的草本园艺观赏植物，虽然两个物种用途广泛，但是它们的分子机制研究一直没有重要突破。为了加速两者分子育种的发展，本研究利用高通量测序技术对芭蕉芋和美人蕉进行 Survey 分析，通过生物信息学分析，完成了芭蕉芋和美人蕉全基因组特征评估，获得了基因组大小、杂合度以及 GC 含量等信息，基于两个基因组的特征比较分析结果完成了芭蕉芋基因组的初步组装。结果表明，通过对芭蕉芋和美人蕉进行高通量测序，分别得到 139.30和 68.10 Gb 高质量的测序数据，总测序深度分别约为 140 x 和 68 x，估算的基因组大小分别约为 844.90 和836.88 Mb；根据 K-mer 分析估算全基因组 GC 含量分别为 39.14%和 38.48%，杂合度分别为 0.63%和1.50%。由此可知，芭蕉芋和美人蕉基因组均属于较为复杂的基因组。对芭蕉芋尝试初步组装后得到总长为 555.60 Mb的基因组。本研究获得了芭蕉芋和美人蕉基因组大小和特征等信息，为芭蕉芋和美人蕉的分子育种研究提供了有价值的数据与思路，初步比较了芭蕉芋和美人蕉基因组特征的异同，为后续构建两者全基因组精细图谱以及比较图谱提供了理论基础。

芭蕉芋；美人蕉；基因组 Survey 分析；基因组大小；杂合度