张守信^1,2 , 陈英转^1,2 , 郑奋³ , 薄文浩⁴ , 周韬^1,2* , 龙文兴^1,2*

1 海南大学林学院, 海口, 570228; 2 海南大学, 热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室, 海南省热带特色花木资源生物学重点实验室, 海南五指山森林生态系统定位观测生态站, 海口, 570228; 3 文昌市林业科学研究所, 文昌, 571321; 4 北京林业大学生物科学与技术学院,北京, 100083
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《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 17 篇   
收稿日期: 2021年03月17日    接受日期: 2021年03月26日    发表日期: 2022年09月13日

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掌叶鱼黄草是一种药用植物，但其药用成分的合成途径和调控基因尚不明确。为了进一步了解掌叶鱼黄草的遗传信息，探寻次生代谢产物合成的分子基础，本研究通过 PacBio 平台对掌叶鱼黄草进行了全长转录组测序。组装测序结果获得 17 339 个 Unigene，注释了 17 163 个 Unigene。有 8 606 个 Unigene 参与了156 条代谢通路。其中包含 18 条次生代谢产物合成通路，相关 Unigene 有 395 个。在这些通路中，苯丙素类、三萜类和叶酸等合成产物可能与掌叶鱼黄草的药用活性有关。本研究为掌叶鱼黄草后续次生代谢产物合成和药理机制研究工作提供基础，全长转录组序列信息可以为后续二代转录组测序结果拼接提供参考模板。

掌叶鱼黄草；全长转录组；基因功能注释；次生代谢产物合成通路