研究报告

香蕉 TCP家族的全基因组鉴定及对低氮胁迫的响应  

阚宝林 , 杨勇 , 杜鹏萌 , 李信平 , 来文杰 , 胡海燕
1海南大学热带作物学院,海口, 570228; 2海南大学,海南省热带生物资源可持续利用重点实验室,海口, 570228
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2021年03月07日    接受日期: 2021年03月18日    发表日期: 2022年07月18日
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摘 要

TCP (Teeosinte branched, Cycloidea, Proliferating cell fatcors 12)是含有一个高度保守非典型的 bHLH (basic-Helix-Loop-Helix)保守结构域的植物特有转录因子基因家族之一,参与调控植物生长发育和非生物胁迫响应等生理过程。为了探究香蕉(Musa acuminata) TCP基因家族对低氮胁迫的响应,本研究从全基因组的分布、蛋白质理化性质、保守结构域等生物信息学方面阐述了香蕉 MaTCPs基因家族成员的基本特征,并且对香蕉叶片和根在低氮胁迫下的 MaTCPs基因家族成员的表达模式进行了分析。结果表明,香蕉TCP转录因子家族共包含 48个成员,可分为 ClassⅠ(PCF)Class(CYC/TB1CIN)两个亚家族,所有成员均定位于除 Chr.09chrUn_random以外的染色体上,且存在多个串联重复基因对。在低氮胁迫下,香蕉MaTCPs基因家族大部分基因表达量上调,且在不同的组织中表达模式不同。同一亚家族基因在根和叶中表现出一致的表达模式。这些结果表明 MaTCPs家族成员可能参与了香蕉对于低氮胁迫的响应。本研究将为香蕉低氮胁迫的机制研究和香蕉 TCP转录因子家族的功能分析提供理论基础,为香蕉抗逆育种提供参考。

关键词
TCP基因家族;香蕉(Musa acuminata);生物信息学;全基因组检索;共线性
《分子植物育种》印刷版
• 第 20 卷
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