沈阳农业大学园艺学院, 设施园艺省部共建教育部重点实验室, 辽宁省设施园艺重点实验室, 沈阳, 110866
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13卷, 第 14 篇 doi: 10.13271/j.mpb.013.000581
收稿日期: 2014年08月28日 接受日期: 2014年10月14日 发表日期: 2014年11月18日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2015 年, 第 13卷, 第 14 篇 doi: 10.13271/j.mpb.013.000581
收稿日期: 2014年08月28日 接受日期: 2014年10月14日 发表日期: 2014年11月18日
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摘 要
SWEET (sugars will eventually be exported transporters) 基因家族是包含2个MtN3/saliva跨膜结构域的膜整合糖转运蛋白,其结构域首次在苜蓿根部结瘤素发现,其后在高等真核生物、原生生物、后生动物、真菌、细菌和古生菌中也有发现。SWEET家族成员中基于MtN3/saliva不同类型的基因多在模式植物拟南芥、水稻中有报道,但其确切的生物学功能与该跨膜结构域的分子功能仍有待研究。本研究利用拟南芥、水稻和番茄基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定了番茄SWEET基因家族成员,利用MAGE4.0软件进行系统发育树分析,并根据水稻、拟南芥等已有研究进一步介绍了各亚族成员的主要功能。通过全基因组分析番茄SWEET家族共有29个成员,在进化上将其划分2个大类4个亚族,其中A1、A2、A3亚族主要涉及单糖转运,B1亚族主要涉及单糖与多糖转运,可为番茄SWEETs家族基因的功能研究与利用奠定基础。
关键词
拟南芥;水稻;番茄;SWEET基因家族