研究报告

杧果叶片响应胶孢炭疽病菌侵染的转录组分析  

叶子1,2 , 孙宇1,2 , 刘志鑫2 , 刘晓妹1 , 蒲金基1,3* , 张贺1,2* , 黄海4 , 宋锦佳5 , 安仕芹5
1 海南大学植物保护学院, 海口, 570228; 2 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所, 农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室,海口, 571101; 3 中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 海口, 571101; 4 贵州省亚热带作物研究所, 兴义, 562400; 5 海南大学生命科学学院,海口, 570228
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2021年02月19日    接受日期: 2021年02月26日    发表日期: 2022年08月01日
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摘 要

为探讨杧果抵御胶孢炭疽病菌的分子机制,分别以感病和未感病的‘贵妃杧’叶片为材料开展转录组测定和分析。本研究以‘贵妃杧’幼嫩叶片为材料,胶孢炭疽菌接种杧果叶片 24 h 后,转录组分析(RNA-seq)感病和未感病叶片之间的基因表达差异,共得到序列 46 733 个,110 个差异表达基因中,67 个基因表达为上调,43 个基因表达为下调。利用 GO 数据库对差异表达基因进行聚类分析,发现差异表达基因主要聚类在细胞及细胞组分、代谢过程、催化活性等方面。利用 KEGG 数据库对差异表达基因影响的通路进行注释后发现,胶孢炭疽菌侵染主要影响了牛磺酸和牛磺酸代谢、淀粉、蔗糖代谢等途径中关键基因的表达水平。Autophagy-related protein 8C-like 11 个基因的 RT-qPCR 验证与 RNA-seq 数据一致,且这些基因在 61224 h 均能迅速响应胶孢炭疽菌的侵染。另外,三羧酸循环(TCA)过程中琥珀酸脱氢酶的 4 个亚基也参与了胶孢炭疽菌侵染杧果的过程。本研究从转录组水平上分析了杧果响应胶孢炭疽菌侵染过程中的一些关键基因,也从胶孢炭疽菌的角度分析了琥珀酸脱氢酶 4 个亚基参与了胶孢炭疽菌的侵染过程,有助于丰富杧果抗炭疽病菌的调控机制以及病原菌 TCA 循环在侵染过程中作用。

关键词
杧果;胶孢炭疽菌;琥珀酸脱氢酶;转录组分析;差异表达基因
《分子植物育种》印刷版
• 第 20 卷
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