丁冬 , 马拴红 , 林源 , 邱小倩 , 万炯 , 孟淑君 , 王琪月 , 张雪海 , 汤继华

河南农业大学农学院, 省部共建小麦玉米作物学国家重点实验室, 郑州, 450002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2021年01月28日    接受日期: 2021年02月04日    发表日期: 2021年07月25日

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转录因子作为转录水平基因表达调控的重要上游因子，广泛参与玉米生长发育相关基因的表达调控，而目前关于转录因子候选基因关联分析的报道较少。为了研究转录因子对玉米表型的潜在影响，本研究以 508 份玉米自交系组成的关联群体全基因组范围内属于 81 个转录因子家族的 2 034 个转录因子序列，结合 21 种已公布的玉米农艺及产量性状表型数据，进行了候选基因关联分析。结果表明，在 Q+K 模型下，共鉴定到 3 578 个 SNP 与 21 种表型显著关联(P≤10^-3)。这些 SNP 解释表型变异范围为 2.37%~68.15%。其中轴色显著关联的转录因子最多，为 105 个；ZmMADS10 关联到的表型最少，只有 8 个。在家族成员 10 个以上的转录因子家族中，G2-like 家族转录因子显著性成员比例最高，FHA 家族平均每个基因含有的 SNP 个数多。这些显著 SNP 位于内含子区、外显子区、5' UTR 区和 3' UTR，分别占比 47.19%、28.20%、12.23%和12.39%。本研究捕获了对玉米生长发育存在广泛调控的转录因子 SNP，为玉米分子标记辅助育种提供了基因资源和分子标记。
 

玉米；转录因子；关联分析；表型