1 晋中学院生物科学与技术系, 晋中, 030019; 2 山西农业大学园艺学院, 太谷, 030801
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 8 篇
收稿日期: 2020年12月17日 接受日期: 2020年12月31日 发表日期: 2023年04月17日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 8 篇
收稿日期: 2020年12月17日 接受日期: 2020年12月31日 发表日期: 2023年04月17日
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摘 要
为了对桃 PpLAC 基因家族的功能进行深入研究,本研究利用生物信息学方法对桃 PpLAC 基因家族进行鉴定,并对其家族成员的理化性质,基因结构,保守基序,染色体定位等进行分析。结果表明,在桃中共鉴定到 54 个 PpLAC 基因家族成员,编码氨基酸在 367~1 559,分子量大小在 40.26~175.15 kD,不稳定系数为 27.92~42.56,等电点为 4.95~9.85,脂肪族氨基酸指数为 75.59~93.87,亲水性为 -0.373~-0.027,表明PpLAC 基因家族成员均为亲水性蛋白。亚细胞定位预测结果表明 60%以上的 PpLAC 蛋白定位在细胞外。PpLAC 基因不均匀的分布在 8 条染色体上。系统进化树分析将 PpLAC 基因家族分成 6 组(G1~G6),并预测不同组成员与木质素及细胞壁合成(G2 组)、生物胁迫及植物开花时间(G3 组)和响应 ABA 信号(G5 组)可能存在着重要的关系,这一结果为更好的研究桃 PpLAC 基因功能提供了理论依据。
关键词
桃;PpLAC 基因家族;生物信息学