研究报告

盐生草(Halogeton glomeratus)着丝粒反转录转座子及卫星 DNA 序列的同源克隆与分析  

彭亚萍1,2 , 陈博1,2 , 张燕1,2 , 宋美妮1,2 , 汪军成1,2 , 姚立蓉1,2 , 孟亚雄1,2 , 马小乐1,2 , 李葆春1,3 , 王化俊1,2*
1 甘肃农业大学农学院, 甘肃省干旱生境作物学重点实验室, 甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室, 兰州, 730070; 2 甘肃农业大学农学院, 兰州, 730070; 3 甘肃农业大学生命科学技术学院, 兰州, 730070
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2020年12月16日    接受日期: 2020年12月25日    发表日期: 2023年04月17日
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摘 要

为研究藜科(Chenopodiaceae)植物盐生草(Halogeton glomeratus)着丝粒区域反转录转座子及卫星DNA 序列的组成,并探讨盐生草、甜菜(Beta vulgaris L.)、藜麦(Chenopodium quinoa Willd.)这三种藜科植物着丝粒反转录转座子及卫星 DNA 序列的异同,本研究利用甜菜基因组中发现的着丝粒反转录转座子家族Beetle7 中的 LTRGagRT 等区段和卫星 DNA 序列 pBv 分别设计 6 对特异引物,以盐生草和藜麦基因组DNA 为模板,利用同源克隆法获得同源序列并和原序列进行比对。结果显示,在盐生草中获得了 LTRGagRT 三个区段的同源序列,相似性依次为 91%92%95%,藜麦中仅存在 RT 同源序列,相似性为 96%;仅在盐生草中获得了卫星 DNA 序列 pBv,同源序列相似性为 93%,藜麦中未获得该同源序列。由此可见,Beetle7 中的 LTRGag RT 序列存在于盐生草中,而藜麦中不存在,卫星 DNA 序列 pBv 也仅存在于盐生草中,更进一步说明藜科植物盐生草和甜菜的亲缘关系更近。

关键词
盐生草;着丝粒;反转录转座子;同源克隆;序列比对
《分子植物育种》印刷版
• 第 20 卷
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