研究报告
薰衣草叶绿体 RNA 编辑位点的预测与分析 
周迪1,2 
,
聂小军2 ,
苏秀娟1 
,
聂小军2 ,
苏秀娟1
1 新疆农业大学农学院, 乌鲁木齐, 830052; 2 西北农林科技大学农学院, 杨凌, 712100
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 9 篇
收稿日期: 2020年11月19日 接受日期: 2020年12月05日 发表日期: 2022年04月28日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 9 篇
收稿日期: 2020年11月19日 接受日期: 2020年12月05日 发表日期: 2022年04月28日
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摘 要
RNA 编辑是转录后水平的一种调控方式，在植物生长发育、形态建成以及逆境响应等过程具有重要作用。为明确薰衣草(Lavandula angustifolia)叶绿体 RNA 编辑的组成及其特点，本研究通过生物信息学和PCR，对薰衣草植物叶绿体的 RNA 编辑位点进行了预测和初步验证。结果发现，薰衣草叶绿体基因组中共预测到 44 个编辑位点，分布于 19 个基因上，且所有位点均为 C 到 U 的转变。利用 PCR 确认了 ndhB-737 是ndhB 的基因编辑位点之一。比较薰衣草与罗勒(Ocimum basilicum)、薄荷(Mentha haplocalyx Briq.)、紫苏(Perilla frutescens (L.) Britt.)、迷迭香(Rosmarinus officinalis)、益母草(Leonurus japonicus Houtt)这五种唇形科植物叶绿体 RNA 编辑位点，发现它们之间存在编辑位点的差异，其中 atpF-31、rps2-83、rpoB-113 rpoB-189、rpoB-809、rps14-27、rp120-103、ccsA-187 和 ndhG-105 这 9 个 RNA 编辑位点是这六种唇形科植物叶绿体所共有。本研究为薰衣草叶绿体 RNA 编辑的生物学功能研究奠定基础，为从 RNA 编辑角度阐明唇形科植物的起源进化关系提供一定依据。
| RNA 编辑是转录后水平的一种调控方式，在植物生长发育、形态建成以及逆境响应等过程具有重要作用。为明确薰衣草(Lavandula angustifolia)叶绿体 RNA 编辑的组成及其特点，本研究通过生物信息学和PCR，对薰衣草植物叶绿体的 RNA 编辑位点进行了预测和初步验证。结果发现，薰衣草叶绿体基因组中共预测到 44 个编辑位点，分布于 19 个基因上，且所有位点均为 C 到 U 的转变。利用 PCR 确认了 ndhB-737 是ndhB 的基因编辑位点之一。比较薰衣草与罗勒(Ocimum basilicum)、薄荷(Mentha haplocalyx Briq.)、紫苏(Perilla frutescens (L.) Britt.)、迷迭香(Rosmarinus officinalis)、益母草(Leonurus japonicus Houtt)这五种唇形科植物叶绿体 RNA 编辑位点，发现它们之间存在编辑位点的差异，其中 atpF-31、rps2-83、rpoB-113 rpoB-189、rpoB-809、rps14-27、rp120-103、ccsA-187 和 ndhG-105 这 9 个 RNA 编辑位点是这六种唇形科植物叶绿体所共有。本研究为薰衣草叶绿体 RNA 编辑的生物学功能研究奠定基础，为从 RNA 编辑角度阐明唇形科植物的起源进化关系提供一定依据。 |
关键词
薰衣草；叶绿体；RNA 编辑；生物信息学
