袁红慧¹ , 李琳玲² , 程华² , 肖贤³ , 程水源^3*

1南京林业大学林学院,南京, 210037; 2黄冈师范学院生物与农业资源学院,经济林木种植改良与资源综合利用湖北省重点实验室,黄冈,438000; 3武汉轻工大学生物与制药工程学院,武汉, 430023
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《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 13 篇   
收稿日期: 2020年11月11日    接受日期: 2020年11月27日    发表日期: 2022年07月20日

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AP2/ERF转录因子广泛参与银杏的生物学过程，其 ERF基因家族存在着通过调控次生代谢来应对环境压力的可能。为探究 ERF基因家族在这一过程中的应答机制，本研究分别构建了紫外和干旱处理下银杏叶转录组数据库，利用在线生物信息学工具对银杏 AP2/ERF转录因子的保守结构域、理化性质及基因家族同源性进行分析，同时利用转录组测序技术检测了 ERF基因家族在这两种逆境胁迫下的表达情况，筛选其中 5个与类黄酮等代谢相关的 ERF基因进行荧光定量 PCR验证分析。结果表明，在银杏中共鉴定到61个 AP2/ERF转录因子，根据其保守结构域特点分为 4类，即 ERF亚家族 28个、DREB亚家族 23个、AP2和 RAV亚家族分别为 5个。不同成员之间的氨基酸数目、等电点(pI)等理化性质有较大差别。从与拟南芥、大豆的序列同源性分析结果来看，同一个亚家族的成员之间亲缘关系较近。GbERF亚家族和 GbDREB亚家族同属于银杏 ERF基因家族，成员数最多。转录组预测分析结果显示，大部分 ERF基因家族成员在紫外和干旱胁迫诱导下的基因表达量会增加。经验证，5个基因表达量的变化情况总体与预测结果一致。本实验结果为后期开展银杏 ERF基因家族的功能研究提供科学依据。

银杏(Ginkgo biloba L.)；AP2/ERF转录因子；ERF基因家族；逆境胁迫