钱金森 , 田雅 , 王飞鉴 , 赵小杰^*

河北农业大学园林与旅游学院,保定, 071000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2020年11月05日    接受日期: 2020年11月13日    发表日期: 2022年07月18日

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为探究 MADS-box基因家族对德国鸢尾多季花品种花期的影响，本研究基于德国鸢尾(Iris germanica)转录组数据，利用生物信息学方法对 MADS-box家族基因进行筛选鉴定，并对其理化性质、功能域及亲/疏水性等方面进行预测分析，且构建德国鸢尾和模式植物拟南芥 MADS-box蛋白家族的系统进化树。结果表明，在德国鸢尾中鉴定出 39个 MADS-box基因家族成员，其编码的氨基酸序列分子量在 4 704.58~30 112.19 kD之间，理论等电点(pI)介于 5.01~10.92之间，其中 32个表现为碱性蛋白，7个表现为酸性蛋白。大多数 MADS-box蛋白定位于细胞核和线粒体基质，少许分布在其他细胞器均不含有信号肽。α- 螺旋和无规则卷曲为二级结构的主要原件，所有蛋白均表现为亲水性蛋白。进化树分析结果显示，德国鸢尾 MADS-box蛋白可聚为 5大类(MIKC, Mα, Mβ, Mγ, Mδ)。本研究可为今后进一步研究德国鸢尾 MADS-box蛋白的生物学功能提供一定的参考依据。
 

德国鸢尾(Iris germanica)；MADS-box；蛋白结构；生物信息学；系统进化树