研究报告

丹参 BZR 基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析  

杜博轩 , 张海花 , 杨东风 , 梁宗锁 , 金伟波*
浙江理工大学生命科学与医药学院, 浙江省植物次生代谢调控重点实验室, 杭州, 310018
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2020年11月04日    接受日期: 2020年11月13日    发表日期: 2022年09月13日
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摘 要

油菜素内酯(brassinosteroid, BR)是一类植物类固醇激素,除了具有生长调节作用外,还具有抗逆功能。BZR (BRASSINAZOLE-RESISTANT)转录因子是油菜素内酯信号转导途径中的调节剂,对植物生长和抵抗环境刺激起着至关重要的作用。本研究对丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge) BZR 成员的全基因组进行鉴定,鉴定得到 6 个成员。通过一系列生物信息学分析对它们的基因结构、进化关系、保守基序、顺式作用元件和茉莉酸甲酯胁迫的转录表达情况等进行了表征。基因结构分析表明同一亚类中各成员的基因结构特征相似;通过系统进化分析,将 6 个丹参 BZR 基因被分为两类;保守基序分析表明 SmBZR 蛋白的 N 末端均含有 BZR基因家族的特征性序列;顺式作用元件分析表明 SmBZR 基因的上游序列含有丰富的与光响应、逆境胁迫响应,植物激素响应和生长发育相关的元件;基于已发表的转录组数据对丹参 BZR 基因的表达情况分析表明它们可能受茉莉酸甲酯调控。本研究为深入了解丹参 BZR 基因家族提供了一定的参考价值。

关键词
丹参;BZR 基因;表达分析;生物信息学
《分子植物育种》印刷版
• 第 20 卷
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