1 贵州师范大学, 贵州省植物生理与发育调控重点实验室, 贵阳, 550001; 2 贵州师范大学, 西南喀斯特山地生物多样性保护国家林业和草原局重点实验室, 贵阳, 550001; 3 贵州师范大学生命科学学院, 贵阳, 550001
作者
通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 8 篇
收稿日期: 2020年11月04日 接受日期: 2020年11月13日 发表日期: 2022年09月07日
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《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 8 篇
收稿日期: 2020年11月04日 接受日期: 2020年11月13日 发表日期: 2022年09月07日
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摘 要
为探究马缨杜鹃叶片基因表达水平对水淹胁迫的响应。本研究分别以水淹胁迫下不同处理时间的马缨杜鹃幼苗叶片和正常叶片(CK)为试验材料,通过 lllumina Hisq 高通量测序平台进行转录组测序,分析水淹胁迫下马缨杜鹃幼苗叶片差异表达基因。结果显示,与对照组相比,水淹胁迫 10 d 后,2 006 个基因呈现差异表达(其中 1 067 个基因上调, 939 个基因下调);水淹胁迫 20 d 后,3 564 个基因呈现差异表达(其中 1 698 个基因上调, 1 866 个基因下调)。对差异表达基因进行 GO 富集分析发现,差异表达基因主要富集在代谢过程、细胞过程、单一生物过程、细胞、细胞区域、细胞膜、细胞膜部分、催化活性和结合蛋白。对差异表达基因进行 KEGG 富集分析发现,差异基因主要富集在植物激素信号转导、淀粉和糖代谢、氨基酸的生物合成及苯丙素的生物合成途径。结果表明水淹胁迫诱导马缨杜鹃叶片相关基因表达,从而响应水淹胁迫,本研究结果为进一步探究马缨杜鹃对水淹胁迫响应分子机制提供初步理论依据。
关键词
马缨杜鹃;转录组测序;水淹胁迫;差异表达基因