南京林业大学林学院, 南京林业大学南方现代林业协同创新中心, 南京, 210037
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 13 篇
收稿日期: 2020年10月30日 接受日期: 2020年11月06日 发表日期: 2022年02月17日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2021 年, 第 19卷, 第 13 篇
收稿日期: 2020年10月30日 接受日期: 2020年11月06日 发表日期: 2022年02月17日
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摘 要
为筛选适用于青钱柳(Cyclocarya paliurus (Batal.) Iljinskaja)不同组织器官的稳定内参基因,本研究利用青钱柳花芽的转录组测序数据,选取 Actin、CYP、EIF、GAPDH、TUB、TEF 和 18S rRNA 共 7 个看家基因作为候选内参基因;以根、茎、叶、雌花和雄花为材料,通过实时荧光定量 PCR (RT-qPCR)技术对各候选内参基因进行扩增。结合 NormFinder、geNorm 和 BestKeeper 等软件分析各候选基因的表达稳定性,用RefFinder 综合分析获得适宜的内参基因。结果表明,不同组织中各内参基因表达稳定性具有一定差别,稳定性综合排序从高到低为 EIF>18S rRNA>TEF>GAPDH>CYP>Actin>TUB。但由于 EIF 较 18S rRNA 的 CT值差异较大,即 18S rRNA 在各组织中的表达量更高,因此本研究确定 18S rRNA 为青钱柳荧光定量分析的最适内参基因,为后续相关基因功能性研究奠定理论基础。
关键词
青钱柳;RT-qPCR;表达稳定性;内参基因