武悦 , 单飞彪 , 闫文芝 , 杨蕾 , 李彦标 , 陈阳

巴彦淖尔市农牧业科学研究院, 农业生物技术研究中心, 巴彦淖尔, 015000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2022 年, 第 20卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2020年10月30日    接受日期: 2020年11月15日    发表日期: 2022年09月15日

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为获得瞿麦(Dianthus superbus L.)的基因数据并了解其基因功能，本研究通过高通量测序技术对瞿麦幼苗叶片的转录组进行测序，并对其进行生物信息学分析。通过 Illumina 测序平台共获得 10 825 条Unigene，总长度为 15 384 267 bp。将获得的 Unigene 分别与 Nr、GO、KOG 等 7 大数据库进行比对，最终有8 255 条(76.26%) Unigene 获得注释。其中 8 201 条 Unigene 在 Nr 数据库中获得注释，注释同源物种主要是甜菜、藜麦；与 GO 数据库比对后获得注释 Unigene 5 886 条，分为细胞组分、生物进程和分子功能 3 个功能大类 23 个亚类；KEGG 数据库共获得注释 Unigene 6 204 条，共涉及 6 大类 45 个亚类 346 个代谢通路，其中以新陈代谢相关通路分布较多；KOG 数据库共获得注释 Unigene 5 303 条，分为 25 个功能类别，基因注释最多的为一般功能和翻译后修饰；在所有 Unigene 中共检测到 SSR 位点 5 201 个，以单核苷酸和三核苷酸重复为主。本研究为开展瞿麦功能基因挖掘、次生代谢途径解析和遗传多样性分析提供了理论基础。

瞿麦(Dianthus superbus)；转录组；基因注释；代谢通路；简单重复序列